南方澳跨港大橋拆遷難度艱辛，且須兼顧證據保全。運安會主委楊宏智說，事發至今，運安會一直有派代表在現場，拆除跟保全過程都會再三確認，並與宜蘭地檢署主任檢察官共同合作。
「最重要的證據都在水底」楊宏智說，要等鋼索、纜繩等構建物證都到位，調查才會有較具體進展，預計兩個月可以發布事實資料，不過進度仍要視現場拆除狀況。
楊宏智說，拆除後的物證會集中在第八號碼頭，由運安會跟主任檢察官共同清點，物證會先目測再做相關工程分析，運安會認為關鍵的構件，也會切除後帶回台北，以電子顯微鏡檢視。
交通部政務次長兼台灣港務公司代理董事長黃玉霖說，拆除過程運安會全程參與，相關證物包含水下攝影，都放在第八號碼頭，供調查小組取得。至於拆遷進度則分五階段進行，若天氣良好、拖吊情況順利，有望提前半個月，也就是10月底前全數拆除並恢復原有航道，屆時運安會所需物證就會全部到位，以利調查。
南方澳跨港大橋昨天完成320噸上方鋼拱拆除吊離工程，水下還有1000公噸的橋面板殘體、200公噸的兩座Y字型橋墩座待拆，今天期前作業，預計明天切割吊離。台灣港務公司指出，橋面板量體大且重，今天先「減重」、刨除橋面板上的柏油鋪面，預計可以減輕200公噸。
至於還被斷橋壓在水下的新臺勝366號與33號兩艘漁船，將等橋體吊起後再拖出。後續拆除工作將採「半半施工」，例如左側施工、右側開放，留出航道以免影響漁民出入漁港作業。
